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《自然》
造礁珊瑚靠光合共生体进食
英国南安普顿大学研究人员发现,造礁珊瑚靠光合共生体养殖和进食。相关论文8月23日发表于《自然》。
研究人员通过一系列长期实验发现,仅靠共生体吸收溶解的无机氮和磷足以维持珊瑚的快速生长。考虑到宿主和共生体的氮和磷预算,研究人员确定这些营养物质是通过共生体“养殖”收集的,并通过消化多余的共生体细胞转移到宿主体内。最后,研究人员利用一个大规模的自然实验证实,在实验室实验中建立的共生珊瑚对溶解的无机营养物质的有效利用有可能在生态系统层面上促进野生珊瑚的生长。以共生体为食使珊瑚动物能够利用营养库,并有助于解释共生珊瑚在营养有限的水域中取得演化和生态成功的原因。
珊瑚礁是高度多样化的生态系统,却能在缺乏营养的水域中茁壮成长,这种现象被称为达尔文悖论。珊瑚动物宿主的能量需求通常可以通过其藻类共生体过量生产富含碳的光合产物来完全满足。然而,人们对珊瑚从其共生体中获取氮和磷等重要营养物质的机制还不完全了解。
相关论文信息:https://doi.org/10.1038/s41586-023-06442-5
《自然-遗传学》
连锁不平衡揭示相邻遗传变异相关性
美国麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所Luke J. O’Connor、Pouria Salehi Nowbandegani和Anthony Wilder Wohns小组合作研发出祖先多样性关联研究中连锁不平衡(LD)的极稀疏模型。相关论文8月28日发表于《自然-遗传学》。
研究人员引入了LD图形模型(LDGMs),这是一种极稀疏和有效的LD表示。LDGM中等位基因之间的统计关系对应于单倍体之间的谱系关系。研究揭示了5个人群组中1800万个常见变体的LDGM和种群特异性LDGM精密矩阵,并验证了它们的准确性,实现了常用LD矩阵计算运行时间数量级的改进。
研究人员采用了一种极快的多祖先多基因预测方法BLUPx-ldgm,该方法的性能优于基于参考LD相关矩阵的类似方法。LDGMs可实现复杂分析,并可应用于数百万个变异和个体祖先多样性的遗传关联数据分析。
研究人员表示,LD揭示了相邻遗传变异之间的相关性。在遗传关联研究中,LD通常使用大型相关矩阵进行建模,但这种方法效率低下,特别是应用于祖先多样化研究时。
相关论文信息:https://doi.org/10.1038/s41588-023-01487-8
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